Thám Tử Lừng Danh Conan là một bộ phim hoạt hình Nhật Bản thú vị và đầy tính phiêu lưu. Câu chuyện bắt đầu với nhân vật chính Shinichi Kudo, một cậu học sinh trung học 17 tuổi thông minh và hóm hỉnh. Trong một lần đi chơi công viên với cô bạn từ thuở nhỏ Ran Mori, Shinichi tình cờ gặp một vụ án giết người trên chuyến tàu tốc hành.
Sau khi giải quyết vụ án, Shinichi trên đường về nhà thì chứng kiến một nhóm người đàn ông mặc đồ đen đang có một cuộc giao dịch mờ ám. Khi bị phát hiện, Shinichi bị họ đánh ngất và cho uống một loại thuốc độc APTX4869 nhằm mục đích thủ tiêu cậu. Tuy nhiên, loại thuốc này đã không giết chết Shinichi mà biến cậu thành một cậu bé tiểu học với cái tên Conan Edogawa.
Từ đó, Conan bắt đầu cuộc sống mới của mình. Cậu sử dụng trí thông minh của mình để giải quyết các vụ án xảy ra xung quanh, trong khi cố gắng tìm cách trở thành Shinichi và đối phó với những người đàn ông mặc đồ đen đã thay đổi cuộc đời cậu.